Bitki ve bitkisel ürünlerde zarara neden olan bakteriler, fitoplazmalar, funguslar, virüsler ve viroidlerin neden oluğu hastalıklar ile yabancı otların teşhisi, yaygınlık ve zarar seviyelerinin belirlenmesi, biyolojileri, epidemiyolojileri ve mücadele olanakları üzerine çalışmalar yürütülmektedir.
Dayanıklılık ıslahı çalışmaları kapsamında bitkilerdeki hastalıklara dayanıklılık mekanizmaları, dayanıklılık genlerinin belirlenmesi ve bu genlerin yüksek verim ve kalite potansiyeline sahip genotiplere aktarılması çalışmalarına ağırlık verilmektedir.
